Основанием для подачи жалобы на действия следователей стало то, что они подробно изъясняют позицию обвинения по уголовному делу, в том числе и в СМИ, тогда как с самих адвокатов взяли подписку о неразглашении следственных действии. Кроме того, по мнению защиты, прокуратура нарушила принцип презумпции невиновности и состязательности сторон. Адвокаты утверждают также, что они не смогли участвовать в назначенном на 11 октября 2005 года судебном заседании по своей жалобе, так как получили извещение из суда только 13 октября.
30 марта 2005 года Мосгорсуд приговорил Пичугина к 20 годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии строгого режима. Его признали виновным в убийстве двоих жителей Тамбова - Ольги и Сергея Гориных - в 2002 году. Кроме того, следствие доказало вину Пичугина в организации покушения на бывшего начальника Управления общественных связей мэрии Москвы, экс-советника бывшего главы "ЮКОСа" Михаила Ходорковского Ольгу Костину. Ему также предъявлены обвинения в убийстве главы администрации Нефтеюганска Владимира Петухова и в двух попытках покушения на предпринимателя Евгения Рыбина.